In drei Hauptfachabteilungen sowie einer Belegabteilung werden im Mariannen-Hospital bei einer Kapazität von 138 Betten jährlich etwa 5300 Patienten stationär umfassend versorgt. Hinzu kommt die ambulante Versorgung von rund 19000 Patienten im Jahr. Zudem wird die Notfallversorgung der Stadt Werl und der umliegenden Region vom Krankenhaus aus geleistet.