Werde ein Teil des Instituts für Medizinische Systembioinformatik (www.ims.bio) und des bAIome Center for Biomedical AI (www.baiome.org) und verstärke unser dynamisches, internationales und interdisziplinäres Team an der Schnittstelle von Bioinformatik, künstlicher Intelligenz, biomedizinischer Forschung und klinischer Anwendung.

Unsere Forschung basiert auf der Analyse großer und komplexer biomedizinischer Datensätze, darunter Omics-, Bild-, Spatial- und klinische Daten. Moderne KI- und datenintensive Analyseverfahren stellen dabei hohe Anforderungen an Compute-, Storage- und Softwareinfrastrukturen. Eine leistungsfähige, zuverlässige und flexibel weiterentwickelbare wissenschaftliche IT-Infrastruktur bildet daher eine zentrale Grundlage unserer Forschung.

In dieser Position gestaltest und entwickelst Du gemeinsam mit unseren Wissenschaftler:innen die technische Infrastruktur für moderne biomedizinische Forschung weiter. Der Schwerpunkt liegt auf Scientific Computing sowie auf der Konzeption, Bereitstellung und Betreuung von Compute-, Cluster-, Storage- und Arbeitsplatzsystemen.

Deine Aufgaben:

• Konzeption, Aufbau, Betrieb und Weiterentwicklung unserer wissenschaftlichen Linux-, CPU- und GPU-Compute-Infrastruktur in Kubernetes
• Administration, Monitoring und Optimierung von Compute-Clustern, einschließlich Nutzer- und Ressourcenmanagement, Performanceanalyse, Wartung, Automatisierung, Backup und Fehlerbehebung
• Beratung von Forschenden bei der technischen Umsetzung rechen- und datenintensiver Forschungsprojekte
• Umsetzung von Anforderungen an IT-Sicherheit, Datenschutz und Forschungsdatenmanagement in Zusammenarbeit mit den zuständigen Stellen des UKE
• Planung und technische Spezifikation neuer Infrastrukturkomponenten sowie Auswahl und Beschaffung von Servern, GPU-Systemen, Speicher-, Netzwerk- und Clusterkomponenten
• Administration und Lifecycle-Management wissenschaftlicher Workstations und leistungsfähiger Analysearbeitsplätze
• Dokumentation von Systemen, Prozessen und technischen Standards sowie Weiterentwicklung von Best Practices für unsere wissenschaftliche Infrastruktur

Diese Position ist drittmittelbedingt zunächst für 2 Jahre befristet.

• Abgeschlossenes wissenschaftliches Hochschulstudium (Master) in Informatik, Bioinformatik, Medizininformatik, Data Science, Computational Science oder einem verwandten Fachgebiet beziehungsweise vergleichbare Qualifikation und Erfahrung
• Sehr gute Kenntnisse in Linux und praktische Erfahrung in der Systemadministration
• Fundierte Erfahrung mit Docker und Kubernetes
• Erfahrung mit der Administration von Compute-, HPC- oder GPU-Clustern
• Gute Kenntnisse moderner Server-, Storage- und Netzwerkarchitekturen
• Erfahrung mit Monitoring (Prometheus, Grafana, Zabbix), Automatisierung (n8n) und der zuverlässigen Bereitstellung von IT- und Compute-Diensten
• Erfahrung mit der Administration und Betreuung von wissenschaftlichen Workstations und Laptops (Windows, Linux, macOS)
• Gutes Verständnis aktueller Hardwarearchitekturen und Interesse an Planung, Auswahl und Beschaffung von Compute- und Storage-Systemen
• Fähigkeit, Anforderungen aus wissenschaftlichen Projekten zu verstehen und in robuste technische Lösungen zu übersetzen
• Strukturierte, eigenständige und lösungsorientierte Arbeitsweise
• Gute Kommunikationsfähigkeit und Freude an der Zusammenarbeit mit Bioinformatiker:innen, Machine-Learning-Forschenden, Biolog:innen, Kliniker:innen und technischen Teams
• Sehr gute Englischkenntnisse sowie gute Deutschkenntnisse

Von Vorteil sind Erfahrungen in einem oder mehreren der folgenden Bereiche:

• große Storage-Systeme und wissenschaftliches Datenmanagement
• Identity- und Access-Management
• Backup-, Archivierungs- und Disaster-Recovery-Konzepte
• IT-Sicherheit und Datenschutz im Umgang mit biomedizinischen oder klinischen Forschungsdaten
• IT-Strukturen eines Universitätsklinikums oder einer vergleichbaren medizinischen Forschungseinrichtung

Wir leben Diversität und schätzen Vielfalt

Wir bieten ein Arbeitsumfeld, das unabhängig von Alter, Geschlecht, sexueller Identität, Behinderung, ethnischer und sozialer Herkunft oder Religion gleiche Chancen ermöglicht. Dieses bestätigen wir mit dem Beitritt zur Charta der Vielfalt. Wir streben ausdrücklich eine Erhöhung des Anteils von Frauen in Führungspositionen an, insbesondere beim wissenschaftlichen Personal in Forschung und Lehre. Gleiches gilt im Falle einer Unterrepräsentation eines Geschlechts im ausschreibenden Bereich. Personen mit Schwerbehinderung werden bei gleicher Eignung, Befähigung und fachlicher Leistung vorrangig berücksichtigt.

> Hier mehr zum Thema „Diversity im UKE“ erfahren.